Découverte prometteuse par des scientifiques turcs ! Découverte d’une nouvelle bactérie qui pourrait être une arme dans la lutte contre la pollution de l’environnement 7 QUESTIONS 7 RÉPONSES

Les humains ont vécu avec des bactéries et des virus à travers l’histoire ; continue à vivre.

Alors que les terres et les glaciers gelés depuis des milliers d’années commencent à fondre en raison du changement climatique, il y a une forte probabilité que d’anciens virus et bactéries soient ravivés ou que des bactéries dont on n’avait pas entendu parler auparavant puissent apparaître. Pour cette raison, de nombreux scientifiques du monde entier mènent des recherches aux pôles.

Enfin, de l’Université Samsun Ondokuz Mayıs Assoc. Dr. Aslihan Kurt Kizildogan et doctorant Cigdem assis de l’Université Hacettepe Assoc. Dr. Sezer Bona identifié un nouveau type de bactérie dans un échantillon d’eau de lac prélevé sur l’île Ardley en Antarctique.

Les bactéries ont remporté le prix Nobel de chimie en 2015 prof. Dr. Aziz Sancarle nom a été donné.

Alors que nous développons une immunité contre certaines maladies causées par des bactéries et des virus dans le monde, ils continuent de trouver de nouvelles méthodes de transmission. Par exemple, nous utilisons des antibiotiques à des fins thérapeutiques depuis que le bactériologiste écossais Alexander Fleming a découvert le premier antibiotique (la pénicilline) il y a une centaine d’années. À leur tour, les bactéries évoluent pour développer une résistance aux antibiotiques.

PEUT ÊTRE UTILISÉ DANS DES ENVIRONNEMENTS POLLUÉS

En disant que lorsqu’ils ont analysé l’ADN de la bactérie, ils ont découvert qu’il offrait une résistance à beaucoup de choses, Assoc. Dr. Eh bien, il a souligné les détails suivants :

— Nous avons vu que les bactéries que nous avons isolées possèdent des gènes qui leur confèrent une résistance aux conditions défavorables à la vie. Ils ont des gènes qui produisent des protéines dans un environnement froid. plus pLorsque nous avons examiné la croissance des bactéries dans des environnements contenant différentes quantités de carburant diesel, nous avons également constaté qu’elles pouvaient décomposer le diesel à un taux de 5 %.

— Il contient également de nombreux gènes qui jouent un rôle dans la résistance à de nombreux antibiotiques. Ce nouveau type, que nous avons brièvement décrit, peut être utilisé dans des environnements où il y a des polluants tels que les métaux lourds et les hydrocarbures, sans nécessiter de températures élevées.

Alors, comment cette bactérie a-t-elle été découverte ? Quelles étapes devraient être franchies lors du prochain processus ? Nous avons discuté de cette question avec trois experts qui ont mené l’étude.

QUELS MESSAGES LES BACTÉRIES POLAIRES DONNENT-ELLES POUR L’AVENIR ?

1-) Ces dernières années, le nombre d’études sur des échantillons ramenés d’Antarctique a augmenté. Il y a deux ans, un groupe de scientifiques turcs a annoncé avoir découvert une espèce bactérienne qui pourrait être utilisée en agriculture. Vous venez d’identifier une nouvelle espèce bactérienne. Comment interpréter ces études et les bactéries apparaissant en Antarctique ?

Assoc. Dr. Aslihan Kurt Kizildogan : Soutenues par le Conseil de Recherche Scientifique et Technologique de Turquie (TUBITAK) lors d’expéditions en Antarctique, diverses études sont menées dans des domaines tels que les sciences physiques, les sciences de la vie, les sciences sociales et les sciences de la terre.

Dans ces études; En plus des recherches telles que la surveillance de l’évolution des glaciers, la surveillance du changement climatique mondial, la détermination du littoral, des projets sont également menés qui étudient la biodiversité de cette région, comme les créatures marines et les micro-organismes. Il existe des bactéries isolées dans le domaine des études sur la biodiversité. Nous essayons de tirer parti de ces caractéristiques en découvrant les caractéristiques saillantes de ces bactéries.

En 2020, une bactérie a été identifiée sous la direction du Centre de recherche et d’application polaire de l’UIT. Le but de l’étude sur les échantillons rapportés de l’Arctique; Il s’agissait de l’identification d’une bactérie qui produit une substance chimique toxique largement utilisée en agriculture et qui provoque une pollution des sols moins nocive… Un résultat concluant. Un type de bactérie a été découvert qui sera utilisé pour détruire les plantes indésirables dans la production agricole.

QUAND LES ÉTUDES SUR LES BACTÉRIES ONT-ELLES COMMENCÉ ?

2-) Comment s’est développé le processus de découverte des bactéries ?

Assoc. Dr. Aslıhan Kurt Kızıldoğan : Prof. de l’Université technique de Karadeniz, qui a participé à la troisième expédition antarctique turque qui s’est tenue de janvier à mars 2019. Dr. Ersan Başar a fourni des échantillons aux chercheurs de divers projets et a transmis les échantillons pertinents à l’Université Ondokuz Mayıs. Puis nous nous sommes lancés dans des études.

QUELS TYPES DE BACTÉRIES TROUVÉES ?

3-) Quel est exactement le type de bactérie ?

Assoc. Dr. Sezer dans l’ordre : En tant qu’espèce, il ressemble au genre ‘Flavobacterium’. Les flavobactéries sont une classe de bactéries présentes dans le sol ou l’eau, dont certaines provoquent des maladies chez les poissons d’eau douce. Cependant, ils n’ont aucun mal connu pour les humains.

Les tests génétiques et biochimiques effectués sur la bactérie que nous avons isolée ont révélé que cette bactérie appartient au genre Flavobacterium, mais diffère des espèces identifiées jusqu’à présent dans ce genre. Étant donné que le groupement d’espèces est une définition plus spécifique, les organismes appartenant à la même espèce devraient se ressembler davantage. Nous avons déterminé qu’il n’y a pas d’autre espèce similaire à la bactérie que nous avons isolée au niveau de l’espèce.

Image au microscope électronique à balayage de bactéries.

COMMENT SE DÉROULE L’ÉTUDE ?

4-) Quelles étapes avez-vous franchies dans votre recherche pour arriver à cette conclusion ?

Assoc. Dr. Sezer dans l’ordre : Il existe différents nutriments que nous utilisons pour faire pousser des bactéries. Vous devez ajouter l’échantillon d’eau du lac à ces milieux et le maintenir à une température convenable pour les bactéries pendant un certain temps. Après un certain temps, la cellule bactérienne se multiplie et forme une structure visible que nous appelons une colonie.

Nous avons également examiné les colonies formées lorsque nous avons maintenu l’échantillon d’eau du lac à 4 degrés pendant 5 jours. Nous avons appliqué un test génétique aux échantillons que nous avons prélevés dans ces colonies pour identifier à quelle espèce appartenait la bactérie. Nous avons étudié la structure de la cellule bactérienne à l’aide de la microscopie électronique. Nous avons découvert les caractéristiques de croissance dans différentes conditions. Ensuite, en examinant toute la séquence d’ADN, nous avons étudié le type de gènes qu’elle possédait.

DANS QUELS DOMAINES SERA-T-IL UTILISÉ ?

5-) Eh bien, dans quelles situations exactement les bactéries acquises peuvent-elles être utilisées ?

Assoc. Dr. Sezer dans l’ordre : Lorsque nous avons analysé l’intégralité de l’ADN de la bactérie que nous avons isolée, nous avons découvert qu’elle possédait des gènes qui lui confèrent une résistance aux conditions défavorables à la vie. La chose la plus importante est que les bactéries ont des gènes qui produisent des protéines dans un environnement froid.

Nous avons également découvert qu’ils possédaient des gènes impliqués dans la décomposition des hydrocarbures tels que le carburant diesel. Lorsque nous avons examiné la croissance des bactéries dans des environnements contenant différentes quantités de carburant diesel, nous avons constaté qu’elles pouvaient décomposer l’huile à un taux de 5 %. Cela nous montre le potentiel de l’utilisation de la bactérie F. aziz-sancarii pour nettoyer les environnements contaminés par le pétrole.

Encore une fois, lorsque nous testons la croissance des bactéries dans des environnements contenant des métaux lourds en laboratoire ; Nous avons constaté qu’il est résistant aux métaux lourds tels que le chrome, le nickel, le plomb, le cuivre, le zinc et le cadmium. En conséquence, cette nouvelle espèce que nous avons décrite peut être utilisée dans des environnements où des polluants tels que des métaux lourds et des hydrocarbures sont présents, de manière indésirable à des températures élevées.

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Des scientifiques turcs ont remporté le prix Nobel de chimie en 2015 pour les bactéries qu’ils ont décrites. Dr. Il a donné le nom d’Aziz Sancar. La bactérie nommée scientifiquement ‘Flavobacterium saint-sancarii’ / Photo : DHA

POURQUOI PROF. DR. NOMMÉ AZIZ SANCAR ?

6-) Pr. à de nouvelles espèces. Dr. Vous vous appelez Aziz Sancar. Comment est née cette idée ?

Site Sidem : Dans la nomenclature scientifique des êtres vivants, il existe différentes classes telles que les espèces, les genres et les familles. Lorsque vous définissez une nouvelle classe directe, vous lui donnez un nom. Mais vous devez suivre certaines règles lors de la définition de ce nom. Vous pouvez donner un nom qui définit la créature, comme une caractéristique distinctive de la créature ou du lieu où elle vit, ou vous pouvez donner le nom d’une personne qui a apporté une contribution importante à la science.

Dans notre entretien avec les scientifiques impliqués dans notre étude, si une nouvelle espèce est définie, elle s’appellera Prof. Dr. Il a été décidé de donner le nom d’Aziz Sancar. Comme vous le savez, il est un leader mondial dans le domaine scientifique… Lorsque notre travail a été accepté pour publication, nous lui avons envoyé un e-mail et lui avons fait savoir. Il a répondu en très peu de temps. Il a donné une réponse très honnête et humble. Il a dit qu’il était heureux.

QUELLES MESURES SERONT PRISES SUIVANTES ?

7-) Quelles sont les prochaines étapes à suivre concernant la bactérie ?

Site Sidem : Tout d’abord, nous avons transformé nos études en articles et les avons soumis à la revue Chemosphere, qui publie sur la pollution de l’environnement. À la suite d’examens par les pairs, notre article a été accepté pour publication et est apparu sur le site Web de la revue. Pour que de nouvelles espèces bactériennes soient enregistrées, ces espèces doivent être reconnues par l’International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, une publication de l’International Committee on Prokaryotic Systematics. Nous contactons actuellement le journal et enregistrons le nom de la nouvelle espèce.

Ces dernières années, la Turquie a progressivement acquis une voix dans la recherche polaire. Ce processus a commencé en 2017 avec l’expédition scientifique nationale sur le continent antarctique. Six vols ont été effectués jusqu’à présent. L’Institut de recherche polaire (KARE) a été créé au sein du Centre de recherche TUBITAK Marmara (MAM) en 2019. De plus, nous disposons de trois systèmes de positionnement global (GNSS), d’une station d’observation météorologique et d’un camp scientifique temporaire sur l’île Horseshoe de l’Antarctique.

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